Outils et logiciels bio-informatique

ProteoConnections est une plateforme bioinformatique conçue pour répondre aux besoins pressants des analyses protéomiques. L'objectif principal de cette plateforme est d'organiser les identifications de peptides et de protéines, d'évaluer la qualité de l'ensemble de données acquises, de profiler les changements d'abondance et d'accélérer l'interprétation des données.

ProteoConnections est une plateforme bioinformatique conçue pour répondre aux besoins pressants des analyses protéomiques. L'objectif principal de cette plateforme est d'organiser les identifications de peptides et de protéines, d'évaluer la qualité de l'ensemble de données acquises, de profiler les changements d'abondance et d'accélérer l'interprétation des données.

Basé sur des sous-routines de ProteoProfile, ADIA est un petit logiciel qui génère des listes d'inclusion LC-MS en extrayant des informations significatives des fichiers Thermo Raw d'ensembles de données spécialement conçus.

Pour faciliter l'analyse des données de spectrométrie de masse à réticulation (CL-MS), nous avons développé CLMS Vault, une suite logicielle conçue pour exploiter les algorithmes CL-MS existants et fournir des outils intuitifs et flexibles pour l'interprétation des données multiplateformes. CLMS Vault stocke et combine des informations complémentaires obtenues à partir de différents agents de réticulation et algorithmes de recherche. Une visionneuse 3D intégrée permet la visualisation de données quantitatives et la cartographie des sites réticulés sur des modèles structurels PDB.